Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CWC25Q9NXE8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CWC25Q9NXE8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CWC25Q9NXE8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms