Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MARCH5Q9NX47 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH5Q9NX47 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH5Q9NX47 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms