Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COMMD8Q9NX08 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COMMD8Q9NX08 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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