Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INTS9Q9NV88 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
INTS9Q9NV88 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
INTS9Q9NV88 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
INTS9Q9NV88 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
INTS9Q9NV88 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
INTS9Q9NV88 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
INTS9Q9NV88 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
INTS9Q9NV88 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
INTS9Q9NV88 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms