Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM140Q9NV12 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM140Q9NV12 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms