Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CENPMQ9NSP4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms