Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC6A13Q9NSD5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC6A13Q9NSD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms