Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOPORSQ9NS56 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms