Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VPS45Q9NRW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS45Q9NRW7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms