Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMYD2Q9NRG4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMYD2Q9NRG4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMYD2Q9NRG4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms