Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
DUOX2Q9NRD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
DUOX2Q9NRD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DUOX2Q9NRD8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms