Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
GDF3Q9NR23 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDF3Q9NR23 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDF3Q9NR23 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms