Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLDQ9NQC7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CYLDQ9NQC7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
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