Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMB3Q9NPA1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMB3Q9NPA1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMB3Q9NPA1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMB3Q9NPA1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNMB3Q9NPA1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMB3Q9NPA1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMB3Q9NPA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMB3Q9NPA1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNMB3Q9NPA1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNMB3Q9NPA1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNMB3Q9NPA1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms