Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA8Q9NP80 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNPLA8Q9NP80 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNPLA8Q9NP80 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms