Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPV4Q9HBA0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPV4Q9HBA0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms