Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CLSPNQ9HAW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CLSPNQ9HAW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLSPNQ9HAW4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLSPNQ9HAW4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLSPNQ9HAW4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms