Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UPF2Q9HAU5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UPF2Q9HAU5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPF2Q9HAU5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms