Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPCSQ9HAB8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPCSQ9HAB8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms