Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS7BQ9H9Q2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COPS7BQ9H9Q2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7BQ9H9Q2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7BQ9H9Q2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7BQ9H9Q2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COPS7BQ9H9Q2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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