Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VIPAS39Q9H9C1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VIPAS39Q9H9C1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms