Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCSER2Q9H7U1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCSER2Q9H7U1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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