Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR55Q9H6Y2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
WDR55Q9H6Y2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms