Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNDC4Q9H6D8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FNDC4Q9H6D8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms