Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NSUN3Q9H649 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN3Q9H649 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms