Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF1DQ9H5J8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1DQ9H5J8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms