Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M3

FBXO44, F-box only protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO44Q9H4M3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO44Q9H4M3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO44Q9H4M3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO44Q9H4M3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FBXO44Q9H4M3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO44Q9H4M3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms