Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOJQ9H4E5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOJQ9H4E5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOJQ9H4E5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOJQ9H4E5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOJQ9H4E5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOJQ9H4E5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms