Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NXF3Q9H4D5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms