Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3E2

SNX25, Sorting nexin-25, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25Q9H3E2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX25Q9H3E2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX25Q9H3E2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX25Q9H3E2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX25Q9H3E2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX25Q9H3E2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms