Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC68Q9H2F9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC68Q9H2F9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms