Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB17Q9H0T7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB17Q9H0T7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms