Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL25Q9H0H3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL25Q9H0H3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms