Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF541Q9H0D2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF541Q9H0D2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms