Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GFRA4Q9GZZ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms