Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD1Q9GZZ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD1Q9GZZ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms