Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTDSP1Q9GZU7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms