Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM6Q9C030 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM6Q9C030 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM6Q9C030 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.5 ms