Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDEM3Q9BZQ6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDEM3Q9BZQ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms