Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CELF4Q9BZC1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF4Q9BZC1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms