Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC4A5Q9BY07 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC4A5Q9BY07 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms