Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
REPIN1Q9BWE0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REPIN1Q9BWE0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms