Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFT27Q9BW83 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFT27Q9BW83 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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