Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VAMP8Q9BV40 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAMP8Q9BV40 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms