Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MKNK1Q9BUB5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MKNK1Q9BUB5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKNK1Q9BUB5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms