Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2orf88Q9BSF0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms