Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GINS3Q9BRX5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GINS3Q9BRX5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms