Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIKE1Q9BRV8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms