Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTP3Q9BQQ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms