Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX50Q9BQ39 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms